Aplikasi Pengujian DNA untuk Dehalococcoides dan bakteri khusus lain untuk Mengevaluasi Bioremediasi
Selama 10-15 tahun terakhir, penggunaan asam nukleat berdasarkan metode (DNA dan RNA), terutama polymerase chain reaction kuantitatif (qPCR), meningkat dengan pesat dalam industri restorasi lingkungan. Alasan antusiasme ini adalah sederhana: DNA dapat diekstraksi langsung dari air tanah, tanah, atau sedimen menghindari bias yang terkait dengan teknik BIAKAN tradisional dan tes qPCR mengukur bakteri khusus (yaitu dehalococcoides) atau proses biologi tertentu yang bertanggung jawab atas kontaminan biodegradasi menyediakan metode yang lebih langsung, akurat, dan sensitif untuk mengevaluasi bioremediasi sebagai tindakan korektif.
QPCR adalah metode molekuler dimana banyak salinan gen khusus yang dihasilkan. Karena setiap salinan gen dibuat, penanda fluorescent dilepaskan, diukur, dan digunakan untuk menghitung jumlah gen target yang ada dalam sampel. Gen disalin selama proses ini (gen target) ditentukan oleh segmen pendek DNA yang disebut "primer" yang ditambahkan ke dalam campuran reaksi. Primer yang berbeda dapat dirancang untuk gen target yang berbeda, tes qPCR dapat dikembangkan untuk mampu menghitung berbagai variasi organisme yang sangat luas dari fungsi biologis termasuk metabolisme kontaminan bawah permukaan.
pelarut diklorinasi termasuk tetrachlorethene (PCE) dan trichloroethene (TCE) yang banyak digunakan dalam berbagai industri / aplikasi komersial kini menjadi kontaminan air tanah terkemuka. Dalam kondisi anaerobik, PCE dan TCE rentan terhadap deklorinasi reduktif proses biologis melalui produk dichloroethene cis-(DCE) dan vinil klorida (VC) menjadi etena, sebuah produk akhir berbahaya. Jadi, bioremediasi anaerobik merupakan ukuran perawatan menarik di situs emp / TCE-terkontaminasi khususnya daerah dimana banyak anaerobik alami.
Beberapa bakteri mampu mengubah emp dan TCE Namun, spesies Dehalococcoides mungkin yang paling penting karena mereka adalah satu-satunya kelompok bakteri yang telah berhasil diisolasi secara lengkap yang mampu merubah emp menjadi etena.
Bakteri Dehalococcoides ethogenes dapat mengekstrak klorin dari bahan kimia untuk membantu membersihkan limbah beracun. Genom (gambar pemetaan gen si sebelah kanan) terdiri dari 1.640 gen. Ilmuwan Cornell berharap untuk mempelajari bagaimana gen bekerja sama untuk proses klorin dan mencari cara untuk membantu bakteri melakukan tugasnya.
Cornell juga berharap dapat mempelajari cara bakteri tertentu yang memecah polutan, bagaimana mereka melakukan pekerjaan dan kemudian untuk membuat mereka lebih efektif dalam membersihkan limbah beracun.
Bakteri ethenogenes Dehalococcoides, ditemukan di lumpur limbah Ithaca pada tahun 1997 oleh James Gossett, kini digunakan luas untuk mendetoksifikasi bahan kimia karsinogenik seperti tochloroethylene ( PCE) dan trichlorethylene (TCE). Mereka melakukan ini dengan menghapus atom klorin dari molekul dan meninggalkan senyawa beracun di belakang.
Tapi ethenogenes D. strain bekerja dengan baik di beberapa situs dan tidak begitu baik pada orang lain, dan tidak ada yang tahu pasti mengapa sangat sedikit yang mengerti tentang bagaimana organisme hidup dan bernapas. Prosedur Normal laboratorium belum memberikan jawaban cukup, karena bakteri sulit tumbuh dalam cawan petri, kata Ruth Richardson, asisten profesor Cornell yang menindaklanjuti Gossett dan Zinder,
Selengkapnya baca di http://www.microbe.com/
Tidak ada komentar:
Posting Komentar